Arcipelago giapponese, 20 anni nel futuro.
La Saturazione Canina ha raggiunto proporzioni epidemiche. L’esplosione di “raffreddore al tartufo” dilaga nella città di Megasaki.
L’influenza canina minaccia di superare i limiti di specie e trasmettersi anche agli umani. Il sindago Kobayashi della prefettura di Uni ordina la quarantena immediata: l’espulsione e la deportazione di ogni razza di cane, domestici e randagi. L’ordine esecutivo elegge Trash Island (l’isola dei rifiuti) a colonia d’esilio.
L’isola dei cani.
Sei mesi dopo, un piccolo monomotore precipita sull’isola straripante e devastata. Un branco di cinque cani affamati ma fieri rovistando fra i rottami scopre il piccolo pilota dodicenne che emerge dalla fusoliera fumante. È Atari, l’orfano protetto del sindaco Kobayashi.
Con l’aiuto dei suoi nuovi amici a quattro zampe Atari parte alla ricerca del suo vecchio cane Spots e, nel frattempo, smaschera la cospirazione politiche che minaccia di distruggere ogni cane della città di Megasaki per sempre.